Impact des perturbations du microbiote sur l’inflammation chronique résiduelle chez les patients infectés par le VIH : étude ciblée sur l’impact du mycobiote intestinal sur l’activation des populations myéloïdes

Résumé du projet

Les traitements anti rétroviraux (TARV) ont permis le contrôle efficace du virus à des niveaux indétectables dans le sang circulant. Cependant, ces traitements ne permettent pas l’élimination totale du virus, ni la correction des effets négatifs induit par l’infection. Une inflammation chronique résiduelle est ainsi retrouvée chez les patients vivants avec le VIH (PVVIH). Plusieurs sources d’inflammation sont classiquement évoquées : (i) le passage de fragments bactériens dans le sang associé aux atteintes de la paroi intestinale, (ii) la persistance du virus, (iii) des dysfonctions du système de défense qui reste activé, (iv) des facteurs individuels (co-infection, tabac, alcool…), (v) la toxicité des TARV aussi évoquée. La contribution relative de chacun de ces paramètres est difficile à évaluer et varie selon les stades et la sévérité de l’infection.

Le projet se concentre plus spécifiquement sur la sphère intestinale. La muqueuse intestinale est une des cibles précoces du virus. L’élimination des lymphocytes T CD4 de l’intestin conduit à une altération de l’épithélium intestinal, une perte de l’intégrité de la muqueuse, qui, plus perméable, va laisser une plus forte proportion de microorganismes pénétrer dans l’ organisme et contribuer à la persistance d’une réponse inflammatoire. Parmi ces microorganismes réunis dans le microbiote, les bactéries sont les plus présentes, mais il y a aussi des champignons (qui constituent le mycobiote). Les PVVIH ont dans le sang, une concentration en 3 -D glucane, un constituant de la paroi de nombreux champignons, augmentée qui ne se normalise pas après mise sous TARV, démontrant une exposition régulière aux champignons. Par ailleurs, il existe des arguments forts démontrant le rôle du mycobiote intestinal sur les cellules immunitaires et l’inflammation, mais également le fort niveau d’interactions entre bactéries et champignons. Ce projet se concentrera donc sur la caractérisation du mycobiote intestinal et complètera les études menées sur l’activation lymphocytaire T, l’activation myéloïde, la caractérisation de l’atteinte de la muqueuse intestinale et de la dysbiose chez les PVVIH. L’étude portera sur 150 PVVIH, présentant des profils d’infection et d’inflammation différents (patients de la cohorte PRMO sous TARV et patients HIV contrôleurs non traités) et comprend un volet de caractérisation du microbiote, et un volet immunologique de caractérisation de l’inflammation et de l’activation myéloïde.